জিয়াউদ্দিন এম চৌধুরী জন্ম সিলেটে। পড়াশোনা করেছেন ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়, পাঞ্জাব বিশ্ববিদ্যালয় (লাহোর), কর্নেল বিশ্ববিদ্যালয় (নিউইয়র্ক) ও আমেরিকান বিশ্ববিদ্যালয়ে (ওয়াশিংটন)। ১৯৬৮ সালে তৎকালীন পাকিস্তান সিভিল সার্ভিসে যোগ দেন। স্বাধীনতার পর তিনি প্রথমে বঙ্গবন্ধুর অধীনে প্রধানমন্ত্রীর সচিবালয়ের বিশেষ সহকারী এবং পরে শিল্পমন্ত্রী এ এইচ এম কামারুজ্জামানের একান্ত সচিবের দায়িত্ব পালন করেন। ১৯৭৫ থেকে ১৯৭৮ সাল পর্যন্ত নোয়াখালীর জেলা প্রশাসক ছিলেন। ১৯৮১ সালের মে মাসে চট্টগ্রামে রাষ্ট্রপতি জিয়াউর রহমান নিহত হওয়ার সময় তিনি ছিলেন সেখানকার জেলা প্রশাসক। পরে বিশ্বব্যাংকে যোগ দেন। বর্তমানে তিনি যুক্তরাষ্ট্রের মেরিল্যান্ডে বসবাস করছেন। তাঁর প্রকাশিত গ্রন্থের মধ্যে রয়েছে অ্যাসাসিনেশন অব জিয়াউর রহমান, ফাইট ফর বাংলাদেশ, বাংলাদেশের চল্লিশ বছর, ইন দ্য নেম অব গড অ্যান্ড রিলিজিয়ন।